Гомогенизатор ультразвуковой Qsonica Q800R2

Описание

Гомогенизатор ультразвуковой Q800R2 создан специально для фрагментации ДНК и хроматина в заданном диапазоне значений длин фрагментов, что достигается подбором интенсивности и времени обработки проб ультразвуком.

Основные преимущества:

обработка в закрытых пробирках предотвращает кросс-контаминацию;

система охлаждения образцов предотвращает их перегрев;

позволяет расщеплять ДНК на фрагменты вплоть до 100 — 200 п.н.;

работа с обычными пробирками (полистирол или поликарбонат предпочтительнее, поскольку меньше поглощают ультразвук по сравнению с полипропиленом);

одновременная обработка до 24 проб.

Контролируемые параметры:

амплитуда / интенсивность — соответствует количеству энергии для передачи образцу в единицу времени;

время воздействия ультразвука на образцы — позволяет снизить нагрев образцов и чередовать циклы обработки ультразвуком и остывания проб;

температура воды в стакане (Cup Horn), в который погружаются пробирки с образцами — позволяет избежать перегрева образцов;

карусель вращает пробирки между циклами обработки ультразвуком — позволяет добиться лучшей обработки образцов.

Характеристики:

цифровое управление обеспечивает воспроизводимые результаты;

наличие окошка с внутренней подсветкой для наблюдения за образцами;

сохранение программ обработки в памяти прибора;

вращающийся держатель пробирок;

максимальная мощность, Вт — 750;

частота ультразвука, кГц — 20;

программируемый таймер — от 1 сек. до 10 часов;

габариты генератора, ШхГхВ, мм — 204х388х216;

габариты бани, ШхГхВ, мм — 293х306х508;

габариты чиллера, ШхГхВ, мм — 280х330х330.

Комплект поставки:

цифровой процессор управления с возможностью сохранения программ и протоколов в памяти прибора;

УЗ-зонд высокой интенсивности излучения (до 750 Вт);

циркуляционный термостат-охладитель (чиллер) для контроля температуры образцов;

звукоизоляционный кожух;

штатив держатель для 8х1,5 мл пробирок;

кабели, шланги.

Аксессуары и опции: 3 варианта штативов-держателей образцов для пробирок от 300 мкл до 1,5 мл.

Работы, в которых использован Q800

Протоколы к Q800R:

ChIP протоколы:

Broad Institute

Sample Prep Protocol

Tissue Protocol

Human Cell Line ChIP Protocol

Mammalian Line ChIP Protocol

C. elegans ChIP Protocol

Yeast ChIP Protocol

Yeast and Mammalian Chromatin Protocol

293T ChIP Protocol

T Cells ChIP Protocol

HCT116 ChIP Protocol

Jurkats, HEK293 Protocol

DNA Shearing протоколы:

Avian Blood/Tissue Genomic DNA Protocol

Bacterial Genomic DNA Protocol

Bacterial Genomic DNA 2 Protocol

Human Skeletal Myoblast (LHCN-M2) Genomic DNA Protocol

E.coli Genomic DNA Protocol

Human Genomic DNA Shearing 1

Human Genomic DNA Shearing 2

Plant Tissue DNA Shearing Protocol

Plant DNA Protocol

Ультразвуковые гомогенизаторы применяются для фрагментации молекул нуклеиновых кислот при ChIP-исследованиях и приготовлении библиотек НК для полногеномного секвенирования на генетических анализаторах (секвенаторах) 2-го поколения (NGS-секвенаторах).

Для некоторых задач предпочтительно не применять прямое воздействие ультразвука на образец, например, при малых объемах пробы (менее 500 мкл), оно может вызвать вспенивание и образование аэрозоля.

Использование емкости, заполненной водой, с опосредованной передачей энергии ультразвукового воздействия на пробу через водную среду, позволяет одновременно работать с большим количеством образцов, в том числе, малого объема, без образования аэрозоля, вспенивания, потери образца и его перегрева.

Пример протокола работы Q800R для образцов в 0,2 мл ПЦР-пробирках:

включите циркуляционный термостат и установите температуру 2°С;

уровень жидкости должен быть таким же или немного выше, чем уровень образца в пробирках;

поместите примерно по 100 мкл раствора образцов ДНК (в стерильной деионизованной воде или TE-буфере) в индивидуальные 0,2 мл ПЦР-пробирки;

охладите образцы ДНК до 4°С;

после охлаждения отцентрифугируйте пробирки в течение 30 сек при 1000 об/мин;

осторожно поместите пробирки в штатив-держатель, стараясь не встряхивать их, чтобы жидкость не попадала на стенки;

осторожно поместите штатив-держатель пробирок в инструмент и закройте крышку;

проведите обработку образцов УЗ в течение желаемого времени, установив амплитуду и продолжительность импульсов;

полученная фрагментированная ДНК может быть теперь использована для приготовления библиотек.